整个空间中最醒目的元素就是由彩绘玻璃装饰的空间和玻璃窗格。绿色、蓝色、橙色和红色的方形玻璃拼成的隔板，插入人字形衡量之间，以及楼梯空间的两侧，表现出现有木质结构的几何形状，同时彩色玻璃窗格也暗示着这里过去作为一座教堂的历史。

而彩色玻璃不仅要受许多影响其外观的调光因素的制约，还要受相对繁琐、纯粹的结构要求的制约，晴朗的早晨，太阳刚刚升起，如果有人走进夏特雷斯大教堂，你的眼睛就会首先被东边的窗户吸引，然后随着阳光从天空升起，这些窗户将会变得更加明亮
这些彩色玻璃花窗是世界上保存最完整、最典型的中世纪彩色玻璃杰作。围绕着圣经故事，这些花窗描绘出近五千个拜占庭风格的人物，它使整个大教堂成为“一座彩色玻璃博物馆”。