西罗马帝国灭亡后，欧洲进入了近千年政教合一的中世纪时期，教权统治使文化、哲学、科学、艺术等领域都附庸于神学。彩绘玻璃作为一种艺术形式在这个时期发展达到巅峰，在教堂装饰中运用空前。

早期花窗玻璃多以圣经故事为内容，以光线配合图案的效果感动信徒。而一些教会所在地本地的传说和神话，也会进入其主题之中。近代以来，花窗玻璃彩色玻璃不仅出现在教堂，也在许多一般建筑、室内空间、产品中获得应用。
英国哥特式教堂的高耸立面与玻璃设计相结合，风格独特而鲜明。而玫瑰窗从相对简单的窗户发展而来，圆形的窗户嵌入彩色玻璃绘画，透光形式绚丽。彩绘玻璃花窗作为教堂采用的一种重要的布道方式，通过人物形象的描绘，向广大识字率低的民众传达《圣经》故事以及历史传奇。
七世纪时，欧洲各地的教堂都使用彩色玻璃，手工制作基督教经文，也是主要产自西欧，之后也是通常用彩色墨水用来装饰，一些十三世纪的彩色玻璃作品也是有很多模仿之前的工艺制品
苏格认为狄奥尼修斯实际上是圣但尼的守护神，因此他将神圣之光的概念融入他的建筑计划中，并围绕着彩色玻璃窗设计了新的大教堂，圣丹尼斯修道院教堂成为这种新型建筑的原型，除了被认为是神圣的光之外，彩绘玻璃和哥特式雕塑一起被称为“穷人圣经”的一部分，因为彩绘玻璃的另一个目的是向文盲传授圣经故事